Описание:
Действие проходит в вымышленном японском городе Кадзамацури, примечательном своей богатой растительностью. Протагонист Котаро и его друзья из общества оккультных исследований учатся в средней школе Кадзамацури, и часто проводят время в комнате общественного клуба. Сюжет начинает развиваться в момент, когда Котаро попадёт в альтернативное измерение Кадзамацури, где царит тишина, а небо серое. Множественные входы в это измерение расположены по всему городу. В этом тайном мире, созданном группой Gaia, свободно бродят демоны, а особая экосистема поддерживает здесь жизнь. Находясь на Луне, с цветущего холма становится отчётливо видно разрушенный город на фоне вечной ночи. Этот холм впоследствии появляется и на Земле в лесу Кадзамацури.
Кадзамацури является полем тайной борьбы между двумя группами: Gaia и Guardian. Организация Gaia, находящаяся под покровительством группы Martel, состоит из нигилистов и мизантропов, способных контактировать с демонами, которые пробуждаются благодаря жизненной силе призывателя. Martel когда-то был церковью и состоит из священнослужительниц с врождённой инвалидностью. Группа Guardian посвятила себя уничтожению демонов и практически полностью состоит из людей, обладающих сверхспособностями. Обе группы прибывают в Кадзамацури, чтобы найти демона по имени Кагари, который выглядит как ученица средней школы. Кагари, главная героиня истории, обладает силой, способной разрушить всю жизнь на Земле, хотя она также может инициировать начало повторной эволюции, которая заново начнёт процесс развития разумной жизни. Однако это произойдёт только при использовании энергии Земли, а во время событий Rewrite запас этой энергии истощается. Gaia хочет захватить Кагари, чтобы ускорить уничтожение человечества, а Guardian ищет Кагари, чтобы убить её, тем самым не допустив гибели человеческих жизней.